Le tube digestif est l’interface principale entre le milieu extérieur et l’intérieur de l’animal. La muqueuse intestinale doit être en capacité de laisser passer les nutriments, minéraux, oligo-éléments et vitamines. En revanche, elle doit empêcher le passage de pathogène dans l’organisme. Le tube digestif joue donc un rôle très important dans la santé des animaux et sur le développement du système immunitaire*.

La muqueuse intestinale est protégée par une couche de mucus. Ce mucus permet de faciliter le transit intestinal et assure une protection physique des cellules de la muqueuse en empêchant les particules et les bactéries d’entrer en contact avec elles.

Les bactéries commensales (microbiote) du tube digestif jouent elles aussi un rôle important dans la protection de la muqueuse. De part leur présence, elles occupent la place physiquement et utilisent une partie du substrat alimentaire pour se développer, privant d’autant les pathogènes de cette source alimentaire. De plus, elles sécrètent des molécules antibactériennes directement dirigées contre certains pathogènes. Dans la même idée, les bactéries lactiques vont produire de l’acide lactique, engendrant une diminution du pH intestinale et défavorisant les pathogènes sensible à l’acidité. Enfin, elles stimulent les plaques de Peyer, favorisant le développement des lymphocytes T et B, et donc la production d’anticorps.